呛奶呛水后会引发咳嗽的原因是因为进入呼吸道的异物，如奶液、水液等刺激神经末梢，使呼吸道肌肉痉挛，引起构成呼吸道的气管、支气管等均受刺激而收缩，产生不适感和咳嗽反应。而咳嗽是一种机体的自我保护反应，它有助于清除呼吸道中的异物，减少对肺部的损伤和防止感染。
当我们喝了奶或水后，若食管和气管没有在吞咽过程中保持良好的协调运动，就可能会发生食物误入气管的情况。因为气管与食管类似下咽器，但却不能区分气体、食物以及其他刺激物质，一旦进入气管就会引起喉部的痉挛性收缩。此时的呼吸动作无法正常进行，导致呼吸困难感的产生，同时喉部或上呼吸道内的神经将向脑部发送咳嗽信号，导致咳嗽的产生，以增加气流与黏液的排出，防止异物进一步引起肺部受损。
此外，呛奶呛水还可能引起口腔、喉咙的组织受到突然的挑战，从而引起充血、水肿，增加上呼吸道分泌物，导致下咳和咳痰的产生，有时甚至还会产生喉痛、声音嘶哑等症状。
因此，为了避免产生呛奶呛水的情况，我们在进食或饮水时要保持充分地咀嚼、慢慢吞咽，同时保持良好的姿势，如头部直立，避免突然转动身体等，这样可以使食品和液体流入食管时尽可能滑动，减少误入气管的可能性。
