孕晚期胎儿畸形的发生率相对其他时期可能略微增加，但并不一定多。根据不同的统计数据，胎儿畸形的发生率在总体孕妇群体中大约是2%到4%。而孕晚期胎儿畸形的发生率通常被认为是1%左右。可见，孕晚期胎儿畸形发生的比例并不明显高于整个妊娠周期中的平均水平。
同时，需要注意的是，孕晚期胎儿畸形的风险与多种因素相关，包括母体年龄、孕周、家族史、遗传因素等。因此，即使进入孕晚期，只要孕妇注意保持健康生活方式、积极接受孕期检查和产前筛查、及时就医治疗等措施，就可以有效降低孕晚期胎儿畸形发生的风险。
特别需要提醒的是，孕晚期胎儿畸形发生的绝大多数情况下，都是早期遗传异常引起的。这些早期遗传异常可导致多种胚胎发育异常，如一些常见的常染色体异常，如唐氏综合征、爱德华氏综合征、帕特劳综合征等，以及少数性染色体异常等。
因此，如果孕期末期孕妇发现胎儿有异常，应该及时就医，接受完善的诊断检查，以便评估胎儿发展情况和健康状况， 接受适当的治疗和管理，把握产时规划，降低不必要的并发症和风险。最好请专业医生对孕妇和胚胎进行高质量的监测和诊断，用科学、有效的手段贯彻预防和管理所有孕期风险。
