怀孕后多久能查出胎儿畸形，会受到很多因素的影响。胎儿畸形检查有很多种方法，其中有些需要在怀孕早期进行，而另一些需要在怀孕后期进行。一般来说，越早进行检查，越容易发现胎儿畸形。下面是一些具体的方法及时间。
1. 超声波检查
超声波检查可以在怀孕的任何时候进行，但最好在怀孕早期适当进行一次。在怀孕前三个月，超声波可检测到一些严重的胎儿畸形，如先天性心脏病、脑积水等。在怀孕后期，超声波仍然可以发现胎儿畸形，但有些已经比较难以发现了。
2. 羊水穿刺
羊水穿刺是可以确诊胎儿畸形的方法之一，但此操作有一定的风险，可能会引起流产或早产等问题。此检查一般在怀孕十四至二十四周进行，但因风险较大，一般只针对有高风险的孕妇进行。
3. 绒毛膜取样
绒毛膜取样是一种安全性比羊水穿刺高的检查方法。此项检查需要在怀孕十四周以后进行，一般在怀孕15至20周之间进行。这种检查能够检测到一些染色体异常和遗传疾病等问题。
4. 无创产前基因检测
无创产前基因检测是一种较新的产前检查方法，采用单倍型SNP(单核苷酸多态性)技术，从孕妇血液中提取胎儿的胎盘DNA进行检查。无创产前基因检测可以在怀孕早期进行检查，并且不需要伤害胎儿，其受关注度越来越高。
总之，每一种检查都有其优缺点，选择合适的检查方法需要根据个人情况权衡利弊。而且只要有可能，应尽可能在怀孕早期进行检查，以便及早发现问题并采取有针对性的方案。
