要判断胎儿是否有畸形基因，可以进行以下几种检查：
1. 安全无损性产前筛查：包括唐氏综合症筛查、三体综合症筛查、神经管缺陷筛查等。这种筛查方法是利用血液和B超相结合的方法进行的，不侵入子宫，对胎儿没有影响。
2. 羊水穿刺：通过抽取羊水进行检测，可以检测出染色体异常和遗传病等问题。但是这种检查有一定的风险，如会增加流产、胎儿畸形的风险等。
3. 绒毛取样：通过取样胎盘绒毛进行检测，可以得到胎儿的染色体情况和遗传病问题。这种方法类似于羊水穿刺，也有一定的风险。
4. 基因检测：利用DNA检测技术，全面地检测孕妇和胎儿的基因情况，可以检测出携带有可能导致胎儿畸形的基因。但是这种检查方法较为昂贵，需要耐心等待结果，且对数据结果的解读要求较高。
总之，对于孕妇和胎儿的健康，预防胚胎发育异常和遗传病问题很重要，选择安全、有效、低风险的产前检查方法非常关键。
