在孕晚期，胎儿的各项器官大致已经发育完全，因此胎儿畸形的风险也逐渐降低。但是，如果存在高风险因素，如妈妈的年龄过大或者已经患有慢性疾病等，医生仍然可能建议进行胎儿畸形的筛查。
在孕晚期，常见的胎儿畸形筛查方法包括羊水穿刺和无创产前基因检测。羊水穿刺需要在孕期16-20周进行，可以通过取得一定量的胎儿羊水进行细胞学和遗传学检查，不仅可以检测胎儿染色体异常，还可以检测胎儿器官形态、功能等方面的畸形情况。
无创产前基因检测是在孕期9周后进行的一种新型筛查方法，它不需要穿刺取样，可以通过抽取孕妇血液中的胎儿DNA进行检测，从而检测胎儿染色体异常、性别、单基因病等情况。无创产前基因检测的准确性较高，但是价格相对也比较昂贵，需要家庭自行承担一定费用。
除了以上两种方法，还有一些孕期超声检查和其他辅助检查也可以用于筛查胎儿畸形，如超声心动图、磁共振成像等。
总之，虽然孕晚期胎儿畸形风险已经降低，但如果存在高风险因素，建议还是进行相关检查以保证胎儿健康。针对不同情况，医生会参考孕妇的年龄、既往病史、家族遗传史等因素，选择合适的检查方法，以确保产妇和胎儿的安全。
