胎儿性别鉴定通常需要在怀孕16~20周左右进行，这时候通过经验丰富的医务人员或者特别的检查设备可以准确地判断胎儿的性别。如果进行产前诊断需确诊唐氏综合征（21三体综合征等）早期筛查、基因诊断等，最好在孕14周以内实施。
在这个时期，胎儿的生殖器官已经发育完全，可以通过B超等检查方法来确定胎儿的性别。这个检查过程并不需要穿刺等进一步的操作，因此对于孕妇和胎儿来说并不会造成什么负面影响。当然，对于一些高风险孕妇来说，医生可能会在14周左右开展唐氏综合征的筛查，以尽早发现和处理问题。
如果期望选择非常准确的胎儿性别鉴定，还可以通过DNA检测方法进行。这种方法常常需要在孕早期进行，因为这时候子宫内环境对DNA样本的质量干扰相对较小，加之胎儿DNA量小，可能有一定的误差，在临床中应用比较少，但是其准确度确实非常高，可以达到99%以上。
总之，胎儿性别鉴定的最佳时间大约在16~20周之间，而且这个检测结果对于孕妇和胎儿来说都是很安全的。当然，如果孕妇想要非常准确的结果，可以采用基因诊断或者其他DNA检测方法来进行。但在任何情况下，孕妇都应该听从专业医生的建议，根据自己的情况选择最合适的检测方案。
