孕晚期两次B超胎心率差别大的原因可能有多种，其中包括以下几个方面：
1. 人为误差：B超检查由人员操作，存在操作不当或技术水平不足等问题，导致读数不准确或不完全，从而导致胎心率数据出现差别。
2. 胎儿状态：同一胎儿在不同时间内的胎心率可能会出现差异，这与胎儿的活动状态、睡眠状态、营养状况等因素有关。如果一次检查时胎儿处于较为镇静的状态，而另一次检查时胎儿处于活跃的状态，就会导致胎心率出现差别。
3. 孕周差异：孕妇的孕周计算可能存在偏差，如果两次检查时间的孕周相差较大，就可能导致胎心率差别较大。
4. 胎位改变：胎儿在子宫内的位置可能会发生改变，尤其是在孕晚期，当胎头朝下入盆后，胎儿活动的空间变小。如果两次检查时胎位出现改变，就可能导致胎心率出现差别。
5. 疾病因素：孕妇在孕期可能患有一些疾病，如高血压、糖尿病等，可能会影响胎心率的测量。如果两次检查时孕妇疾病情况有所变化，就可能导致胎心率出现较大差别。
总之，孕晚期两次B超胎心率差别较大并不一定意味着出现了问题，但如果差异较大或胎心率过低或过高都需要及时就医，避免对胎儿造成不良影响。
