在人类的孕期中，胚胎的发育非常重要，以正确的方式进行胚胎发育至关重要。 胎儿的性别是通过遗传决定的，由父亲提供的X或Y染色体确定。 但是，这并不是说90天的胎儿性别就一定确定了，因为有许多因素会影响胎儿的性别确定。
首先，染色体异常可能导致胎儿性别异常。例如，当父母染色体发生异常时可以导致X-XY、XO和XXX等性染色体异常。此外，由于体外授精技术和人工授精，在人类自然孕育的基础上，有关胚胎的人工干预也会导致性别异常。 所以，在胚胎移植前介入控制或选择性别是可能的，这种技术被称为“性别选择”。
其次，在90天左右，胎儿的生殖器官才刚刚开始形成。在此之前，生殖器官的发育仅仅是一些基本的生殖细胞的形成和移动。 由于性别决定基因的作用，男性和女性的生殖系统的形态和结构也不同，并且进一步地，生殖器官的形成可以受到众多因素的影响。例如，胎儿内部的激素水平、基因表达和其他环境因素对生殖器官形成可能会产生影响，这些会对生殖器官的形态和结构产生影响。
最后，胎儿的性别能否确定还取决于医生的技术，因为在生殖器官尚未成熟时对其进行观察可能影响准确性。 因此，即使90天胎儿的性别已基本确定，也有可能出现错误的诊断。
总结而言，虽然胎儿的性别是父母的基因遗传所决定，但人体的发育是一个极其复杂和多变的过程。 染色体异常、生殖器官的发育和医学技术等因素均可能影响胎儿性别的确定。 因此，在90天时要想准确确定胎儿的性别需要经过多方面的考虑和综合分析。
