在怀孕的前三个月，胎儿的发育具有极高的敏感度，容易受到外界因素的影响，因此该阶段胎儿畸形率相对较高。而进入孕中期，胎儿的器官系统基本形成，其畸形率有所降低，但仍不可忽略。
在孕中期（约为孕期的第4-6个月），胎儿的器官已经大致发育成型，大部分器官的生长发育处于加速期。胎儿此时的主要工作是继续快速地增重，并不断发展和成长，身体组织的分化和器官的完善也在不断进行。此时的胎儿已经具备了完整的主要器官，如心脏、肝脏、肺、肾、脑等，器官的功能也在逐渐完善。
但是，即便在孕中期，胎儿的发展仍然会面临不同的风险因素，从而导致胎儿发生畸形。一些孕妇可能会受到一些不利因素的影响，如食物中的毒素、药物、放射线、过多的压力、感染等，这些因素都可能对胎儿造成损害，最终导致胎儿畸形的发生。
此外，在孕中期，胎儿内环境可能对发育造成一定的不良影响。孕妇若患有有害疾病或慢性疾病，如糖尿病、高血压等，不仅可能导致孕妇自身的健康问题，同时还可能会给胎儿带来严重的不良后果。
总的来说，虽然孕中期胎儿畸形率相对于怀孕前期有所降低，但孕妇在孕中期仍需保持警惕，避免因外界因素或自身原因对胎儿造成不良影响。孕妇应该注意合理饮食，避免接触有害物质，保持良好的生活习惯和心态，同时定期进行孕期检查，以确保胎儿的健康发育。
