畸形胎儿遗传疾病的概率取决于遗传方式、基因型、家族史等因素。不同的疾病通过不同的遗传方式传递，常见的遗传方式有常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、X染色体连锁遗传、自体隐性遗传和复杂遗传等。
对于常见的遗传疾病，如唐氏综合症、神经管缺陷等，其发生概率比较稳定，一般是0.1% ~ 0.2%左右。如果家族中有患病者，那么患病概率会有所增加。例如，如果父母其中一方是唐氏综合症的携带者，那么在怀孕时，胎儿患病的风险会增加到1% ~ 2%左右。
对于罕见的遗传疾病，由于患病的基因变异比较特殊，因此患病概率也相应较低。但是，如果家族中存在多人患病，或者父母双方都是基因携带者，那么患病的风险将会比较大。
除了遗传因素外，其他因素如母亲的孕期营养、环境和生活方式等也会对胎儿的健康产生影响。因此，在怀孕期间应该保持良好的生活习惯，避免烟酒和较差的环境条件，同时接受适当的检查和治疗，以确保胎儿的健康。
