胎儿消化系统畸形是指在胎儿发育过程中，消化系统出现异常，包括口腔、食管、胃、小肠、大肠、肝、胆等器官的发育异常，导致出现各种畸形，包括口腔裂、消化道狭窄、闭锁、扭曲、变形等。检查胎儿消化系统畸形的方法有以下几种：
1.超声检查
超声可以清晰地表现胎儿的器官结构和内部组织，可以对口腔、食管、胃、小肠、大肠、肝、胆等器官进行评估和诊断，以及检测它们是否正常发育。常见的消化系统畸形如食管狭窄、食管闭锁、胃黏膜下瘤等都可以通过超声检查来发现。
2.羊水穿刺
羊水穿刺是通过穿刺胎儿的腹部，将羊水采出进行检测的方法。可以检测胎儿的染色体、基因、代谢问题等。如果存在胎儿口腔、食管、胃、小肠、大肠、肝、胆等器官的异常，也可以在羊水中检出。
3. 胎儿磁共振成像(MRI)
胎儿磁共振成像(MRI)是一种无辐射的诊断方法，对于一些无法通过超声检查到的分辨率较低的畸形进行检查时有优势。该技术可以通过在计算机中生成高分辨率的图像，帮助医生更好地诊断和治疗消化系统畸形。
4.经阴道超声
经阴道超声也可以被称为内超，是一种非常准确的检查胎儿畸形的方法。它的优势在于可以拍摄更加清晰的图像。这种技术利用高频声波的振动来检查胎儿的口腔、食管、胃、小肠、大肠、肝、胆等器官。通过经阴道超声，可以检查出分辨率较低的隐性和明显的畸形。
总之，对于胎儿是否存在消化系统畸形的诊断，还需要做一些其他的辅助检查，例如羊水检测、胎盘检测等，以充分了解胎儿的情况。医生需要综合考虑各项检查结果，制定正确的治疗方案。同时，孕妇也应该进行定期产检，并根据医生的提醒进行一些必要的特殊化学检测。这样可以及时发现和处理胎儿畸形，保证胎儿的正常生长和发育。
