在怀孕初期，胎儿的器官和组织正在发育，随着孕期的进行，宝宝的身体状况也会逐渐稳定。通常医生会在怀孕12周左右进行第一次孕期检查，这时可以通过B超检查胎儿是否健康，是否存在畸形。但是，胎儿的器官和组织的发育需要时间，因此三个月的B超检查能否完全发现畸形，就需要考虑具体情况了。
首先，需要了解的是，B超检查并不能完全发现所有的胎儿畸形。例如，细小的畸形、某些先天病变等常常需要进一步检查才能确定。而且胎儿的某些发育情况可以在晚期才完全显示出来，因此即使在孕早期B超检查没有发现异常，也需要在孕后期进行进一步的检查。
其次，需要根据孕妇的具体情况来判断是否需要进行另外一些检查。例如，如果孕妇的家族中曾经有过某些遗传疾病的情况，那么就需要进行基因检测来确定胎儿的风险。而如果孕妇的孕期异常，如出现阴道流血、羊水过多、宫缩等情况，也需要进行更加频繁的检查。
最后，需要注意的是，即使B超检查没有发现异常，孕妇也需要保持警惕，定期进行孕检。如果发现任何不寻常的情况，应及时与医生联系。只有这样才能确保胎儿健康成长。
综上所述，三个月能否完全发现胎儿畸形是需要具体情况而定的，需要进行定期检查和其他检查来确定胎儿的健康情况。孕期健康是非常重要的，希望每一个准妈妈都能做好孕期检查并保持良好的心态。
