胎儿在孕期中的性别差异是逐渐形成的，而这一过程主要是由遗传因素决定的。
最初，受精卵中的性染色体可以是X或Y，男性的性染色体为XY，女性为XX。在卵子与精子结合时，如果卵子受精的是X染色体的精子，就会形成一个XX的胚胎，而如果受精卵受精的是Y染色体的精子，便会形成XY的胚胎。
胎儿的性别差异在大约7周时开始出现，此时性腺已经开始分化。男性的性腺会变成睾丸，产生睾酮和睾丸素等雄性激素，而女性的性腺则变成卵巢，产生雌性激素。在第12周，男性胎儿的外生殖器会变成阴茎和阴囊，而女性则会形成阴道和阴唇。一般来说，可以在13-14周通过B超进行性别鉴定，这项技术可以通过判断胎儿的生殖器官的发育情况来确定性别。
但是需要注意的一点是，在孕期早期，男性和女性胎儿的生殖器官发育的差异并不明显，稍有偏差就可能导致性别判断错误。因此，由于技术的不完备和误差，目前对于胎儿性别的判断仍然需要结合多种检测结果进行判断。
总之，胎儿的性别差异主要是由遗传和胎儿发育过程中的生物化学反应所决定的。在孕期早期，胎儿的性别差异并不十分明显，直到13-14周时才能通过B超等技术进行性别鉴定。
