胎儿发育的过程非常复杂，需要与母体的外界环境密切配合，一旦出现了某些状况，就会有可能引发胎儿发育异常。而造成胎儿畸形的时间因其成因而有所不同，有些可能在受孕初期就有异常，而有些则可能在孕期较晚时才出现。
受孕初期是胎儿重要的发育时期，此时为胚胎期，开始形成内脏器官和神经系统。因此如果在受孕初期，胎儿就受到了某些影响，就可能会导致畸形。比如，如果孕妇在怀孕初期不慎吸入有毒气体或是接触了放射线，就有可能对胎儿的发育造成影响，可能引发造影剂综合症、常染色体延迟、先天性颅骨畸形等病变。
此外，孕期中后期的胎儿近期出现了各种系统的器官发育，如胎儿骨骼系统、血管系统等，更容易对外界的影响产生反应，引发畸形。比如感染某些病原体如弓形虫病、单纯疱疹病毒等，产生的免疫反应可能会导致胎儿畸形。
此外，孕妇在孕期过程中，良好的生活习惯和营养均衡的饮食自不必说，还要避免生活中的紧张和疲劳，对身体造成损害可能导致产生某些病症，使胎儿在发育过程中受到极大的伤害。因此，在怀孕期间，孕妇要保持心情愉快，适当活动，避免不良的习惯，组织孕期检查，及早发现、预防和治疗疾病，减少胎儿畸形的发生率。
