胎儿畸形指的是胎儿在孕期发育过程中出现的异常的形态或结构。有些畸形是遗传性的，有些是环境因素引起的。对于怀孕女性而言，检查胎儿畸形是非常重要的，因为这可以帮助及早发现问题并作出相应的处理。
那么，3个月的时候可以查胎儿畸形吗？答案是可以。在孕早期，常常通过超声波和其他方法进行筛查，以确定胎儿是否存在畸形或异常。
首先，孕早期的第一次产检通常在怀孕6~8周时进行。在此时间段内，可以进行超声波检查，以确定胎儿的发育状况。超声波检查可以帮助医生检测出一些常见的胎儿畸形，如唇腭裂等。
此外，孕早期的第二次产检通常在怀孕10~13周时进行。在此时间段内，可以通过羊水切片或羊水穿刺等检查，来确定胎儿是否存在染色体异常。这些检查也可以帮助医生发现一些常见的畸形，如脊柱裂等。
总之，孕早期可以通过超声波和其他方法来检查胎儿畸形。然而，需要注意的是，在怀孕早期，胎儿畸形的发现率相对较低，因此需要在孕晚期进行更加细致的检查，以确保发现问题。如果有任何疑问或担忧，建议及早向医生咨询，以获得更加详细的建议和指导。
